Facture électronique : ce qui change pour une exploitation agricole (2026-2027)
Par L'équipe iPlantia — 8 octobre 2026facture électroniqueréglementationTVAgestion exploitationcoopérative
La réforme de la facturation électronique n’est plus une échéance lointaine : elle est entrée en vigueur le 1er septembre 2026. Pour une exploitation agricole, elle se joue en deux temps : recevoir dès maintenant, émettre à partir de septembre 2027. Voici ce que cela change concrètement, et comment ne pas se laisser surprendre.
Le calendrier en deux étapes
| Date | Qui | Quoi |
|---|---|---|
| 1er septembre 2026 | Toutes les entreprises assujetties à la TVA | Être capable de recevoir des factures électroniques |
| 1er septembre 2026 | Grandes entreprises et ETI | Émettre des factures électroniques |
| 1er septembre 2027 | PME et micro-entreprises | Émettre des factures électroniques et transmettre l’e-reporting |
Source : entreprendre.service-public.gouv.fr et impots.gouv.fr.
La quasi-totalité des exploitations sont des PME ou des micro-entreprises : l’émission devient obligatoire pour vous en septembre 2027. En revanche, vos gros fournisseurs (machinisme, agrofourniture, énergie) sont souvent des grandes entreprises ou des ETI : ils vous envoient déjà leurs factures sous forme électronique. Il vous faut donc dès aujourd’hui de quoi les recevoir.
Ce qu’est (et n’est pas) une facture électronique
Un PDF envoyé par e-mail n’est pas une facture électronique au sens de la réforme. La facture doit être émise dans un format structuré, lisible par une machine (Factur-X, UBL ou CII), et passer par une plateforme agréée par l’administration fiscale (on parlait auparavant de « PDP », plateforme de dématérialisation partenaire). La plateforme du vendeur transmet la facture à celle de l’acheteur et envoie les données utiles à l’administration.
Chaque entreprise choisit sa plateforme. La seule liste qui fait foi est la liste officielle des plateformes agréées publiée par impots.gouv.fr.
La réforme ajoute aussi quatre mentions obligatoires sur les factures : le numéro SIREN du client professionnel, l’adresse de livraison si elle diffère de celle du client, la nature des opérations (livraison de biens, prestation de services, ou les deux), et la mention « option pour le paiement de la taxe d’après les débits » le cas échéant.
Trois situations propres à l’agriculture
Vous êtes au remboursement forfaitaire agricole
Le régime du remboursement forfaitaire ne dispense pas de tout : Réussir rappelle que les exploitations sont concernées, qu’elles relèvent du remboursement forfaitaire ou du réel TVA. Vos fournisseurs, eux, émettront des factures électroniques. Pour vos ventes, le traitement exact dépend de votre situation : faites le point avec votre centre de gestion ou votre expert-comptable.
Vous vendez en direct à des particuliers
Une vente à un particulier ne donne pas lieu à une facture électronique. Mais si vous êtes assujetti à la TVA, elle devra être déclarée à l’administration : c’est l’e-reporting. Il concerne aussi les ventes à l’étranger. Pour un producteur en vente directe (marché, magasin à la ferme, paniers), c’est la partie de la réforme qui demande le plus d’organisation : chaque vente doit être enregistrée quelque part pour pouvoir être déclarée.
Votre coopérative facture à votre place
Beaucoup de coopératives et de négoces pratiquent l’autofacturation : ce sont eux qui établissent la facture de vente de vos céréales, à votre nom. Avec la réforme, cette autofacture vous arrive par votre plateforme. Elle reste votre facture de vente : vous devez pouvoir la consulter, et la contester si les quantités ou le prix ne correspondent pas à ce qui était convenu.
Autre pratique courante : la compensation. La coopérative solde ce qu’elle vous doit (vos apports) contre ce que vous lui devez (vos achats d’appro), et seul le solde circule. Factures de vente et d’achat doivent alors être rapprochées les unes des autres, pas seulement du relevé bancaire.
Ce qu’il faut faire dès maintenant
- Choisir une plateforme agréée pour recevoir vos factures, si ce n’est pas déjà fait (votre logiciel de gestion ou votre centre de gestion en proposent souvent une).
- Vérifier votre SIRET et ceux de vos clients professionnels : sans eux, une facture ne peut pas être acheminée.
- Organiser le traitement des factures reçues : qui les valide, où on les range, comment on les rapproche de ses achats.
- Recenser vos ventes aux particuliers, si vous en faites, pour préparer l’e-reporting de 2027.
- Prévoir la conservation : une facture se conserve 6 ans au titre du droit fiscal et 10 ans au titre du droit commercial.
Comment iPlantia vous accompagne
Le module Facturation d’iPlantia (abonnement Premium) a été construit autour de ces obligations :
- Une plateforme agréée intégrée : iPlantia se connecte à Super PDP, une plateforme agréée par l’administration fiscale. Une fois la connexion faite, vos factures de vente partent et vos factures d’achat arrivent sans quitter iPlantia. Sans connexion, iPlantia génère quand même vos factures au format Factur-X, à déposer sur la plateforme de votre choix.
- Les factures reçues reliées à vos saisies : iPlantia vous propose de relier une facture d’achat à la dépense que vous aviez prévue, à un entretien ou un achat de matériel, à une charge fixe. Pour une facture d’engrais ou de semences, un clic fait entrer les produits en stock, au prix de la facture. Rien n’est compté deux fois : la facture confirme le montant et la date de paiement de ce qui était déjà saisi.
- L’autofacturation et la compensation prises en charge : les autofactures de votre coopérative arrivent avec le badge « Émise par l’acheteur », et vous pouvez les contester. Un écran dédié solde vos ventes contre vos achats chez un même partenaire.
- Les ventes aux particuliers déclarées pour vous : une fois votre régime de TVA renseigné, chaque vente à un particulier est transmise à Super PDP, qui la déclare selon le calendrier de votre régime.
- Une conservation de 10 ans : chaque facture est horodatée, verrouillée et vérifiée régulièrement. Vous pouvez à tout moment télécharger vos archives (fichiers originaux, empreintes, jetons d’horodatage, mode d’emploi pour tout vérifier vous-même), même sans abonnement.
Le détail, écran par écran, est dans le guide Facturation.
Voir aussi : Trésorerie agricole → · Gestion des stocks d’intrants → · Contrats de vente de céréales →
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